硬核支撐基孔肯雅熱防控！華大智造T1+測(cè)序儀破譯病毒全貌
近期，廣東省佛山市等地報(bào)告基孔肯雅熱確診病例。面對(duì)輸入與本地傳播的雙重挑戰(zhàn)，華大智造的基因測(cè)序技術(shù)為快速病毒溯源提供了關(guān)鍵技術(shù)支撐，其長(zhǎng)短讀長(zhǎng)測(cè)序平臺(tái)在實(shí)踐中形成了優(yōu)勢(shì)互補(bǔ)的“黃金搭檔”。其自主研發(fā)的短讀長(zhǎng)測(cè)序儀DNBSEQ-T1+（簡(jiǎn)稱“T1+”）和長(zhǎng)讀長(zhǎng)測(cè)序平臺(tái)CycloneSEQ G100-ER（簡(jiǎn)稱“G100-ER”），分別在疾控實(shí)驗(yàn)室與海關(guān)口岸場(chǎng)景中發(fā)揮核心作用，助力實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)防控。截至目前，近400臺(tái)由華大智造提供的全讀長(zhǎng)（SEQ ALL）系列測(cè)序儀已部署于全國(guó)各地疾控和海關(guān)系統(tǒng)，隨時(shí)待命應(yīng)對(duì)突發(fā)公共衛(wèi)生事件。
在病毒剛開(kāi)始傳播、基因組信息未知的情況下，疾控系統(tǒng)通過(guò)“T1+”測(cè)序儀完成4例基孔肯雅病毒感染者樣本的全基因組測(cè)序，破譯基孔肯雅病毒全貌，覆蓋度均超99.9%，成功區(qū)分東中南非型與亞洲型病毒株。針對(duì)1例極低載量樣本，該平臺(tái)通過(guò)宏轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)仍獲取完整病毒序列，驗(yàn)證了其在復(fù)雜樣本中的高效溯源能力。作為全球首款24小時(shí)產(chǎn)出Tb級(jí)數(shù)據(jù)的桌面測(cè)序儀，“T1+”集成樣本制備與生物信息分析模塊，實(shí)現(xiàn)“測(cè)序-分析一體化”全閉環(huán)流程，SE50測(cè)序最快僅需7小時(shí)，大幅提升突發(fā)疫情響應(yīng)效率。
華大智造測(cè)序技術(shù)在此輪基孔肯雅熱流行的成功應(yīng)用并非偶然。早在2024年1月，廣州醫(yī)科大學(xué)附屬市八醫(yī)院就曾聯(lián)合華大智造，利用優(yōu)化的宏轉(zhuǎn)錄組測(cè)序策略和MGISEQ-2000測(cè)序儀，成功實(shí)現(xiàn)了對(duì)一例極低載量基孔肯雅輸入病例（旅行史為東帝汶）的高效溯源，獲得了全長(zhǎng)基因組并確認(rèn)了其進(jìn)化分型。
在海關(guān)口岸等一線防控前沿，CycloneSEQ平臺(tái)憑借納米孔技術(shù)的實(shí)時(shí)性、便攜性成為關(guān)鍵工具。應(yīng)用CycloneSEQ平臺(tái)，如G100-ER測(cè)序儀進(jìn)行基孔肯雅病毒全基因組測(cè)序，數(shù)據(jù)顯示僅需20分鐘產(chǎn)生的數(shù)據(jù)即可達(dá)到100%的基因組覆蓋度，與傳統(tǒng)高通量測(cè)序結(jié)果一致。這種“即測(cè)即判”能力避免了樣本轉(zhuǎn)運(yùn)延遲，助力海關(guān)從源頭攔截輸入病例。
基因測(cè)序技術(shù)也正加速走向更廣泛的應(yīng)用。2024年全國(guó)共有37款基因測(cè)序儀獲NMPA批準(zhǔn)用于臨床檢測(cè)，其中23款基于華大智造DNBSEQ技術(shù)，占國(guó)內(nèi)總獲證數(shù)量的62%。截至2024年末，華大智造全球基因測(cè)序儀累計(jì)銷售裝機(jī)總數(shù)已超4500臺(tái)，占全球新增銷售裝機(jī)市場(chǎng)份額約28.2%，較2023年顯著提升9.5個(gè)百分點(diǎn)。同時(shí)，其業(yè)務(wù)布局已從核心的基因測(cè)序儀和實(shí)驗(yàn)室自動(dòng)化，拓展至包括生物樣本庫(kù)、細(xì)胞組學(xué)、時(shí)空組學(xué)等在內(nèi)的多組學(xué)綜合工具。公司還在司法、動(dòng)物疫病等領(lǐng)域積極拓展，并與法國(guó)研究基金會(huì)合作推動(dòng)微生物研究。
臨床、農(nóng)業(yè)、疾控、海關(guān)等多場(chǎng)景需求的爆發(fā)與放量，疊加多組學(xué)業(yè)務(wù)的高速增長(zhǎng)和核心測(cè)序儀裝機(jī)量的持續(xù)攀升，為華大智造未來(lái)業(yè)績(jī)提供了堅(jiān)實(shí)的驅(qū)動(dòng)力。面對(duì)未來(lái)，作為全球首個(gè)且國(guó)內(nèi)唯一同時(shí)擁有大規(guī)模商業(yè)量產(chǎn)級(jí)短讀長(zhǎng)（DNBSEQ）與長(zhǎng)讀長(zhǎng)（CycloneSEQ）測(cè)序產(chǎn)品的企業(yè)，華大智造有望依托自主可控的核心技術(shù)，在生命科學(xué)工具領(lǐng)域持續(xù)擴(kuò)大市場(chǎng)份額，實(shí)現(xiàn)穩(wěn)健的業(yè)績(jī)?cè)鲩L(zhǎng)，同時(shí)持續(xù)為病原微生物監(jiān)測(cè)與防控提供多元化、全場(chǎng)景的解決方案，助力筑牢公共衛(wèi)生安全屏障。
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